黄兴赠蔡锷对联
寄字远从千里外，
论交深在十年前。
护国讨袁 团结政党
1913年3月20日，袁世凯派人暗杀国民党代理理事长宋教仁，1913年7月12日“二次革命”爆发，黄兴由上海至南京，强迫江苏都督程德全宣布独立，黄兴被推为江苏讨袁军总司令，即日通电就职。他派往徐州的讨袁军迅速失败，不久南昌和南京相继失陷，“二次革命”失败，黄兴再次逃往日本。
1914年2月，黄兴在东京创办浩然庐与政法学校，培养干部。孙中山在日本将国民党改组为中华革命党，把党员分成首义、协助、普通党员三等，要求党员绝对服从孙中山，并发誓、按指模。黄兴被选为协理。黄兴认为党员都是生死与共的革命同志，应该平等，不赞成重新组党并且拒绝加入。孙中山不同意，二人发生争执，后应孙中山之要求，黄兴决定远行美国。6月30日，黄兴由日本搭轮赴美国，7月15日到旧金山时，黄兴接到一些拥护者的来信，希望他另行组党。黄兴：“党只有国民党 领袖只有孙中山”
袁世凯倒行逆施，遭到全国人民的抵制与反对。黄兴认为讨袁时机已经成熟，必须立即行动起来，把国内各种反袁力量团结起来，他通过函电与国内诸多同志联络，鼓励同志各就力之所及，分别活动，不论各党派政见如何不同，只要他们现在反对帝制，肯出力打倒袁世凯，都要与他们合作。1915年9月，黄兴在美国接到蔡锷派专使送来的17页密信陈述国内详细的局势，拟计赴难讨袁，急切征询黄兴的意见。黄兴则认为把西南实力聚结起来，摆在第一线，可以形成一股威慑力量。于是黄兴设机关于日本马关，为美国、北京、昆明三处转信，筹商一切。当时，蔡锷尚在北京，如何设法使蔡锷安全离京赴滇，则是实现讨袁护国战争的关键。为此，黄兴命长子黄一欧动身东返日本驻扎，以便与各方保持密切联系。嘱留驻日本的张孝准即刻回国，专门负责协助蔡锷出逃。随后又派在美国随员石陶钧回国前往帮办。12月上旬，蔡锷离开北京至天津。张孝准在天津预为安排，蔡锷登上日本的昭和轮船。蔡锷在日本没有居留，即乘船南下，前往海防登陆，与两名勇土同行，经过关卡，盘查甚严，击毙岗哨，通过云南最荒凉地段，于12月19日到达昆明。与此同时，黄兴多次函电在南洋筹运饷械的李烈钧，速归云南起兵。李烈钧偕熊克武、龚振鹏等秘密于12月17日抵昆明。这样，就实现了蔡锷、唐继尧、李烈钧等西南实力的聚结，为讨袁护国作好军事力量的准备。
黄兴在策划讨袁战争过程中，制定周详的策略。同时黄兴还在整个讨袁护国战争期间，与各护国军军政首领，中华革命军将领均有函电往来，或来人，或遣人前往直接联系，运筹帷幄，使整个战争进展有序，节节胜利。黄兴通过这些函电，向各省军政首脑、社会名流贤达，通报有关情况，争取他们的理解与支持，坚定他们的反袁信心和决心，形成广泛的讨袁联盟起到了巨大的作用。1915年12月12日，袁世凯公然宣布恢复君主制度，自称为“皇帝”。把民国五年改为“洪宪”元年，这更加激起了全国人民的反对。根据黄兴发动讨袁护国战争的统一部署，蔡锷、李烈钧等到昆明后，立即同唐继尧共同商议讨袁战争的方针与计划。1915年12月25日，唐继尧、蔡锷、李烈钧领衔通电，宣布云南独立，讨袁护国战争爆发。他们以反对袁世凯复辟帝制，捍卫共和制国体为宗旨。争取全国人民的支持，取得护国战争的胜利。同一天，唐继尧致电黄兴，报告云南宣布独立，揭开护国战争的序幕，并期望黄兴及时了解战局，多方关注。1916年3月23日，袁世凯在全国人民的声讨中，被迫宣布取消“洪宪”帝制年号。3月26日，全国17省国会议员谷钟秀等电告各国公使，通电各省，迫袁氏退位。事实证明，护国讨袁战争领导人，是按照黄兴总策划的方略进行的，黄兴在护国讨袁战争中，发挥了领导组织的巨大作用，从讨袁时机的把握，发动起义地点选择，主要作战军队的领导人联络，到组织联络国内各省军政要人，社会贤达，请他们顾全大局，迅速参加反对袁世凯卖国独裁行列中来，就是袁世凯手下心腹，也作，团结争取工作，动员他们看清形势，迅速脱离袁氏，使袁世凯走向众叛亲离，自绝于人民之死路。6月9日黄兴自日本电黎元洪，请恢复民元约法，召集国会，严惩祸首。7月4日，黄兴从日本返回上海。10日留沪国会议员欢宴黄兴，同孙中山恢复了往日的亲密关系，一道为恢复《临时约法》，组织内阁、惩办帝制祸首而斗争。
